《基因组大数据k-mer频谱分布规律统计分析》
杨振华 著
出版社:吉林大学出版社
出版时间:2023年5月
定价:48.00
ISBN:978-7-5768-1756-0
内容简介
基因组序列的k-mer频谱是物种特有的,解读k-mer频谱产生的内在规律,对于揭示基因组的序列组成规则和基因组的进化模式具有重要的意义。本书以八类920个物种基因组序列为样本,将k-mer和哈希表索引模型算法相结合,构建预测模型,研究了基因组序列k-mer频谱的三峰和单峰分布现象,发现物种基因组中存在两种统计模型,一种是CG独立选择规律,另一种是TA独立选择规律。两种独立选择规律均具有5个性质:独立性、选择性、保守性、相关性和趋同性。独立选择规律的发现对于基因组进化的研究和功能序列的信息分析具有理论指导价值。
作者简介
杨振华,现就职于内蒙古科技大学,讲师,毕业于内蒙古大学物理科学与技术学院物理学专业,博士学位,研究生学历。主要从事生物信息大数据分析方面的研究。先后在 BMC Evol Biol 和 Genomics 国际期刊上发表多篇论文。